持株会で積み立てた自社株は、原則として「いつでも自由に市場で売却できる」状態ではありません。多くの場合、株式は持株会名義で一括管理され、個人は持分として保有します。そのため、売却するにはまず持株会から株式を引き出す（自分名義の証券口座へ振替する）手続きが必要になります。

引き出しや売却のタイミングは、持株会の規約で定められています。申請は月1回や四半期ごとなど受付頻度が決まっていることが多く、申請締切日から実際に売却できるまで数週間かかるケースもあります。また、決算前後などはインサイダー取引防止の観点から、引き出しや売却が制限される期間が設けられている場合があります。

売却回数や金額にも制限があることがあります。「年間〇回まで」「一定口数以上でないと引き出せない」といった条件は会社ごとに異なるため、必ず規約の確認が必要です。加えて、持株会の事務手数料、証券会社での売買手数料などのコストも発生します。

税務面では、売却益が出た場合は株式の譲渡所得として課税対象になります。特定口座（源泉徴収あり）で売却すれば申告不要となることが多い一方、口座区分によっては確定申告が必要になるため注意が必要です。